福王便放下了心，安心的准备称帝事宜。1644年五月朱由崧被四镇拥立于南京，改元“弘光”。政治上：
朱由崧下令为北京殉难诸臣上谥号，文臣二十一人、勋臣二人、戚臣一人。随后又给郢国公冯国用、宋国公冯胜、济国公丁德兴、德庆侯廖永忠、长兴侯耿炳文等开国功臣追上谥号；给方孝孺、齐泰、黄子澄、陈迪、景清、卓敬、练子宁等建文朝死难诸臣，蒋钦、陆震等正德朝死谏诸臣，左光斗、周朝瑞、周宗建、袁化中、顾大章、周起元等天启朝死珰难诸臣上谥号。
官员人员中：
朱由崧依照廷臣会推，马士英加东阁大学士、兵部尚书、右副都御史衔，仍任凤阳总督。不久又以阮大铖为礼部左侍郎，与原礼部尚书王铎，二人兼东阁大学士入阁办事。
国策上：
弘光政权的基本国策以“联虏平寇”为主。其对手有两个：大顺的农民军与清军。由于弘光政权兵力有限，两线作战难度很大，弘光皇帝则是采取联虏平寇的政策。阮大铖与马士英都是“联虏平寇”方针的赞决者。
财政上：
朱由崧一登大位立即想在生活上同承平时期的皇帝看齐。他下令为自己和太后修建宫殿，为筹备大婚四出购买珠宝。弘光君臣的大肆搜括民财，经营自己的安乐窝。
军事上：
以总兵刘泽清辖淮、海，驻淮安，做一路招讨事；总兵高杰辖徐、泗，驻泗州，经理开、归一路招讨事；总兵刘良佐辖凤、寿，驻临淮，经理陈、杞一路招讨事；靖南伯黄得功辖滁、和，驻庐州，经理光、固一路招讨事。
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